DETEKSI VIRUS DEN-I BERBASIS LOOP MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION (LAMP) DAN DIPSTIK NUCLIC ACID LATERAL FLOW (NALF)
Abstract
Demam berdarah Dengue adalah penyakit infeksi yang disebabkan oleh
virus Dengue (DENV) I, II, III, dan IV yang disebarkan oleh nyamuk Aedes aegypty
dan Aedes albopictus . Lebih dari sepertiga populasi dunia yang tinggal di daerah
yang memiliki risiko transmisi Dengue. Di Indonesia, mencakup 30 provinsi, wabah
dengan angka kejadian yang luar biasa tinggi dilaporkan dari 293 kota dan
kabupaten di 17 provinsi. Perlindungan yang paling efektif terhadap dengue adalah
menghindari gigitan nyamuk. Saat terjadi infeksi, pengenalan dini dan perawatan
suportif yang memadai dapat menurunkan risiko berkembangnya penyakit menjadi
lebih berat (CDC, 2010). Hal inilah yang menjadi alasan pentingnya dilakukan
deteksi dini pada kasus-kasus DD dan DBD. Penelitian menggunakan metode
diagnosa berbasis assay LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification) yang
merupakan pendekatan baru untuk amplifikasi asam nukleat berdasarkan prinsip
reaksi strand displacement dan pembentukan struktur loop dalam mengamplifikasi
target. Hasil positif dapat divisualisasikan dengan baik pada reaksi one-step RT dan
LAMP selama 30 menit. Kami menggunakan dipstik berlabel antibodi anti biotin
dan probe berlabel FITC sehingga reaksi positip dapat divisualisasikan dengan baik
berupa 2 garis keunguan. Kemudahan dan keakuratan dalam melakukan metode
deteksi dini serta kemudahan dalam peralatan dan analisis hasil yang dapat diamati
tanpa instrumen yang rumit menjadi latar belakang yang kuat untuk memilih
pengembangan metode tersebut dalam deteksi dini Dengue di Indonesia.
Keywords
Full Text:
PDFReferences
CDC. Epidemiology of Dengue Fever and Dengue Hemorrhagic Fever. http://www.cdc.gov/dengue/
epidemiology/index.html. Download 28 Juli 2010
Nagamine, K., T. Hase, and T. Notomi. 2002. Accelerated reaction by loop mediated Isothermal
amplification using loop primers. Mol. Cell. Probes16:223–229
NIAID. 2009. Dengue Fever : Overview. http://www.nih.in/iaf/to5/i2/print.html. Download 28 Juli 2010
Notomi, T., H. Okayama, H. Masubuchi, T. Yonekawa, K. Watanabe, N. Amino, and T. Hase. 2000.
Loop-mediated isothermal amplification of DNA. Nucleic Acids Res. 28:e63 (i–vii).
Parida, M. M., P. Guillermo, S. Inoue, F. Hasebe, and K. Morita. 2004. Real-time reverse transcription
loop mediated isothermal amplification for rapid detection of West Nile virus. J. Clin. Microbiol.
:257–263.
Hong, T. C. T., Q. L. Mai, D. V. Cuong, M. M. Parida, M. Harumi, M. Tsugunori, F. Hasebe, and K.
Morita. 2004. Development and evaluation of a novel loop-mediated isothermal amplification method
for rapid detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus. J. Clin. Microbiol. 42: 1956–
Innis, B. L., A. Nisalak, S. Nimmannitya, S. Kusalerdchariya, V. Chongswasdi, S. Suntayakorn, P.
Puttisri, and C. H. Hoke. 1989. An enzyme-linked immunosorbent assay to characterize Dengue
infections where Dengue and Japanese encephalitis co-circulate. Am. J. Trop. Med. Hyg. 40:418–427.
Kuno, G. 1998. Universal diagnostic RT-PCR protocol for arboviruses. J. Virol. Methods72:27–41
Morita, K., M. Tanaka, and A. Igarashi. 1991. Rapid identification of Dengue virus serotypes by using
polymerase chain reaction. J. Clin. Microbiol. 29:2107–2110.
Shu, P. Y., S. F. Chang, Y. C. Kuo, Y. Y. Yueh, L. J. Chein, C. L. Sue, T. H. Lin, and J. H. Huang. 2003.
Development of group and serotype specific one-step SYBR Green based real-time reverse
transcription PCR assay for Dengue virus. J. Clin. Microbiol.41:2408–2416.
Soegijanto, S. 2006. Demam Berdarah Dengue edisi 2. Surabaya : Airlangga University Press
Umniyati, S.R., Sutaryo, Wahyono, D., Artama, W.T., Mardihusodo, S.J., Soeyoko, Mulyaningsih, B.,
Utoro, T. 2008. Application of monoclonal antibody DSSC7 for detecting dengue infection in Aedes
aegypti based on immunocytochemical streptavidin biotin peroxidase complex assay (ISBPC).Dengue
bulletin vol 3.
WHO, 2009. Dengue Guidelines for Treatment, Prevention and Control.
License URL: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0